208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4632 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
183 aa  384  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.78 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.22 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.7 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
182 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
182 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  35.52 
 
 
188 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.91 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.88 
 
 
188 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.52 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  32.04 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
188 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  31.89 
 
 
199 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
187 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  33.14 
 
 
177 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.35 
 
 
188 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  31.35 
 
 
188 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.83 
 
 
188 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
187 aa  104  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  34.24 
 
 
185 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
183 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
194 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  32.61 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  32.61 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  29.38 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
188 aa  94.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.98 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
190 aa  91.3  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
190 aa  90.9  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.98 
 
 
181 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
181 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  31.72 
 
 
178 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  34.9 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.8 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.55 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.59 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  30.81 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.72 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.32 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.99 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.61 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.54 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.19 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.45 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.69 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.6 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  31.06 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.08 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  26.7 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.75 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.63 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.86 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.02 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.75 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  28.09 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.42 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  28.65 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.85 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.31 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  31.02 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.12 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.11 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.78 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.53 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.65 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  28.18 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.85 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  24.59 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  26.35 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.33 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.9 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.67 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>