214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3635 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  78.61 
 
 
187 aa  309  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  66.84 
 
 
190 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  57.89 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  54.69 
 
 
192 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  55.32 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.44 
 
 
189 aa  187  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.56 
 
 
181 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.56 
 
 
181 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 
201 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  42.71 
 
 
179 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.6 
 
 
180 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  38.62 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.59 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  42.11 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.52 
 
 
221 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.94 
 
 
221 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.52 
 
 
210 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.5 
 
 
217 aa  104  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 
224 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.08 
 
 
200 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.44 
 
 
196 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  37.13 
 
 
198 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
178 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.21 
 
 
209 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.31 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.12 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.39 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.92 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.52 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
183 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  32.8 
 
 
183 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
204 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  37.95 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.45 
 
 
189 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.57 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.86 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.35 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  35.06 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  33.73 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  33.73 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 
218 aa  89  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.35 
 
 
180 aa  88.6  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  35.57 
 
 
208 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.89 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.89 
 
 
178 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.7 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  33.83 
 
 
219 aa  84.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  34.55 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  36.59 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  34.83 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.21 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.67 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  32.66 
 
 
190 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
186 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  35.6 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  36.46 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  30.85 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.21 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  37.2 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.34 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.42 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.12 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.93 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.81 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  35.85 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3213  putative secreted protein  38.46 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.82639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.9 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.4 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.15 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.85 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>