250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3871 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
180 aa  366  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.26 
 
 
183 aa  189  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.53 
 
 
157 aa  158  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  39.56 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  41.44 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.44 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.95 
 
 
210 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  34.46 
 
 
219 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.61 
 
 
182 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  38.33 
 
 
181 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  39.01 
 
 
199 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  39.39 
 
 
221 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.98 
 
 
192 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.97 
 
 
221 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.39 
 
 
221 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
221 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.1 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  33.85 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
201 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.97 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
201 aa  92  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.04 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 
217 aa  91.3  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
192 aa  91.3  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.56 
 
 
192 aa  91.3  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.05 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
219 aa  90.9  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.07 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.04 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
228 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.1 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.35 
 
 
208 aa  88.6  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  33.96 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
187 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  34.36 
 
 
218 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  34.22 
 
 
213 aa  86.3  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  35.39 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.66 
 
 
221 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.2 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.82 
 
 
204 aa  84.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.11 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.62 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  29.89 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.59 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.63 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.74 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  32.11 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  29.44 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  34.52 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.48 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.74 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.84 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  33.84 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  27.69 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.85 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.22 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.76 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.94 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.78 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.47 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.88 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  29.74 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  32.22 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.78 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.74 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.33 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  30.51 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  34.27 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>