139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2027 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
221 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  67.42 
 
 
214 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  65.16 
 
 
217 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  65.16 
 
 
217 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  65.16 
 
 
217 aa  284  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  66.06 
 
 
209 aa  281  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  57.66 
 
 
205 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
208 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.93 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.93 
 
 
200 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.72 
 
 
217 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  41.86 
 
 
219 aa  138  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  39.09 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.72 
 
 
219 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.01 
 
 
204 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.19 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.08 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  42.16 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.44 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.62 
 
 
221 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  39.44 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  38.6 
 
 
198 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  39.72 
 
 
218 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  38.91 
 
 
215 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  41.67 
 
 
205 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.21 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  36.74 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  33.95 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.57 
 
 
201 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.33 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  36.89 
 
 
221 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.19 
 
 
179 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.62 
 
 
196 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.28 
 
 
201 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.5 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.57 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.62 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  40.47 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  32.37 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.62 
 
 
183 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  36.96 
 
 
181 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  33.67 
 
 
178 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  36.11 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.4 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.13 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.49 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.49 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.72 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.52 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.06 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.23 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  25.48 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  25.96 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  32.52 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.39 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.62 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.58 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.01 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.08 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  26.04 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  30.33 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.41 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.18 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
192 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
187 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.65 
 
 
179 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.18 
 
 
194 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.02 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.87 
 
 
177 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  32.37 
 
 
184 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
208 aa  61.6  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.81 
 
 
192 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.17 
 
 
190 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  30.56 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
178 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.77 
 
 
157 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 
187 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.39 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  29.25 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  26.6 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.64 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.52 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.21 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.52 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  31.34 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.87 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  29.91 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.15 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>