198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1769 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
191 aa  374  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.54 
 
 
189 aa  124  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  92  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
188 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  35.2 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  37.65 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.87 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.88 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.43 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
177 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  34.1 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
224 aa  80.9  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.19 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  35.32 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  33.96 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.14 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  34.98 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.02 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.76 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  30 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.7 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.34 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.41 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.18 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.04 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.62 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  38.84 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.37 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  29.71 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  29.8 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.69 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.08 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.31 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.94 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.44 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  33.14 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.09 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.59 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.19 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  30.05 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  35.78 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  31.96 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  34.9 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.86 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.87 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  27.92 
 
 
190 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.79 
 
 
196 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
218 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.78 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  28.42 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.35 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.69 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.52 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  30.22 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
188 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.63 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>