249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5564 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.96 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.17 
 
 
212 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.24 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  33.51 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  32.31 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  32.64 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.19 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.51 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.87 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.44 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.12 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  33.16 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.96 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  38.24 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  37.14 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.28 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.06 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.6 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.09 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.35 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.06 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.77 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.8 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.92 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.08 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.28 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.12 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  27.84 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  34.01 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.93 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.89 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.31 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.89 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.9 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.67 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  31.28 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  30 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  31.31 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  33.6 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.53 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.49 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  32.49 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  30.61 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30.46 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.56 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.93 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.67 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.6 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  29.86 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.53 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  28.11 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.27 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.97 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.52 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  28.95 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.15 
 
 
219 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>