219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2243 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.43 
 
 
183 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  53.85 
 
 
182 aa  220  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  46.59 
 
 
177 aa  168  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.32 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
188 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.44 
 
 
183 aa  120  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.91 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.15 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.57 
 
 
182 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
199 aa  111  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  37.1 
 
 
188 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.57 
 
 
182 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  36.99 
 
 
200 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
190 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
187 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.7 
 
 
188 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
188 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
188 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
188 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
187 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
188 aa  99  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
176 aa  97.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
176 aa  97.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  35.44 
 
 
167 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  32.04 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
182 aa  94.4  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
186 aa  94.4  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.09 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.31 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.09 
 
 
183 aa  90.9  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.8 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  35.26 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  32.58 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
203 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.75 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
187 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.28 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.64 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  32.68 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  33.68 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  28.11 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  31.05 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  29.84 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  29.17 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.86 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  32.2 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.72 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.65 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.89 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.08 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.42 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.88 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.25 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.35 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  33.7 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  31 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.67 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.27 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  32.19 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>