268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3441 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
188 aa  383  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  54.05 
 
 
190 aa  207  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.24 
 
 
190 aa  151  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.84 
 
 
199 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.11 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  37.63 
 
 
188 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.57 
 
 
187 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.25 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  38.25 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.49 
 
 
187 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  40.11 
 
 
187 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.71 
 
 
187 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.57 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.36 
 
 
186 aa  124  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 
188 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.17 
 
 
186 aa  120  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  36.93 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  34.43 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  37.24 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
183 aa  117  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  40.43 
 
 
190 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.24 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.7 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.02 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.02 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.04 
 
 
180 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.22 
 
 
191 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  35.14 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
187 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 
180 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  32.62 
 
 
181 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.7 
 
 
193 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
184 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  37.43 
 
 
178 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  38.04 
 
 
176 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  42.55 
 
 
182 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
178 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.89 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.04 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.65 
 
 
182 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.7 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.32 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  29.89 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  37.04 
 
 
177 aa  95.9  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.62 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.53 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.97 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.04 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.71 
 
 
179 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.22 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.45 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  32.97 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.56 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
200 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  34.15 
 
 
180 aa  92  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  34.95 
 
 
185 aa  92  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  35.48 
 
 
167 aa  90.9  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  35 
 
 
186 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 
190 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.44 
 
 
204 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  35.71 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  34.15 
 
 
181 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  35.35 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.43 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  34.03 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 
221 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.34 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
212 aa  80.9  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>