194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0711 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
176 aa  357  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  71.43 
 
 
176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  71.02 
 
 
176 aa  263  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  71.59 
 
 
176 aa  261  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  70.06 
 
 
177 aa  247  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  39.25 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.76 
 
 
188 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
188 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
187 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  35.56 
 
 
182 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  38.1 
 
 
190 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.8 
 
 
182 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  36.96 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
182 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
183 aa  97.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 
187 aa  97.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
186 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.58 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.51 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.76 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  40.25 
 
 
187 aa  94.4  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.25 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  37.71 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.52 
 
 
182 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.25 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  36.61 
 
 
189 aa  87.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.31 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.31 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.5 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.06 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  39.62 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.82 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  42.5 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  31.85 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.91 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  29.48 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.53 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  35.16 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.83 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.89 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.44 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.11 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.69 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.15 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  33.96 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.34 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.94 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  33.81 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.97 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.87 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.33 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  36.51 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.93 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.43 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.94 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.76 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.37 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36.8 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
190 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.65 
 
 
224 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.71 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  30.16 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.79 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.57 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.53 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.43 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.5 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  31.29 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.25 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>