163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4615 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
193 aa  391  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  79.57 
 
 
185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28040  dihydrofolate reductase  53.85 
 
 
183 aa  181  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160923  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.13 
 
 
188 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.46 
 
 
186 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  48.91 
 
 
187 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.53 
 
 
191 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0206598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0230  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  49.73 
 
 
184 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.83 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.86 
 
 
188 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  44.86 
 
 
188 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  44.15 
 
 
188 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  43.09 
 
 
199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.7 
 
 
188 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.02 
 
 
190 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.1 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.57 
 
 
187 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  36.22 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.89 
 
 
187 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.31 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.7 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  38.54 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  36.61 
 
 
177 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  38.5 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  35.52 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  33.88 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.5 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  40.97 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.21 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.42 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  29.79 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.65 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  26.38 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.61 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.11 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  31.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  23.37 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.65 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.46 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.86 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  30 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  30.27 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.93 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
178 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.96 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.21 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.33 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.57 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.23 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  26.06 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
186 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.47 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  29.58 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.81 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  28.83 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.13 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.91 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  26.2 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  31.93 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  28.11 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.85 
 
 
188 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.42 
 
 
181 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.91 
 
 
178 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  25.68 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.4 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.67 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  29.08 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  23.89 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.3 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.42 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>