189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4552 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  62.77 
 
 
188 aa  214  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.56 
 
 
181 aa  207  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  57.92 
 
 
188 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  57.14 
 
 
167 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  45.56 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45 
 
 
182 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  41.44 
 
 
185 aa  134  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.89 
 
 
182 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  41.57 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  42.78 
 
 
200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  40.33 
 
 
185 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  39.66 
 
 
177 aa  124  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.44 
 
 
184 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  39.78 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  37.02 
 
 
182 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.96 
 
 
183 aa  111  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
183 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.41 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.26 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.26 
 
 
181 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.41 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
199 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
190 aa  92  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.28 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  41.96 
 
 
151 aa  89  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
181 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  31.72 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
187 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.81 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.23 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  37.09 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
188 aa  84.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.43 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  33.87 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.63 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.34 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  33.95 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  31.98 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.89 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.62 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.92 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.44 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.62 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.76 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.59 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.06 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  28.11 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.76 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  33.89 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.23 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.58 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  32.28 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  34.41 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  34.59 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.01 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.4 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  34.07 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>