168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3672 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  81.88 
 
 
186 aa  256  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  83.22 
 
 
194 aa  256  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  81.88 
 
 
185 aa  253  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  73.83 
 
 
185 aa  239  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  60.4 
 
 
182 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.67 
 
 
182 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60 
 
 
182 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  59.86 
 
 
200 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  40.85 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  38.51 
 
 
179 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
188 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.96 
 
 
183 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.93 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 
183 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.16 
 
 
188 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.78 
 
 
181 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
188 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.56 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.62 
 
 
201 aa  77  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.88 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.37 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.87 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
183 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  37.41 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.51 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  35.1 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.27 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.24 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.36 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.03 
 
 
215 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.51 
 
 
209 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  29.73 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.1 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.67 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.24 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.92 
 
 
217 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
217 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
217 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  36.67 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.28 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.47 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.03 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.49 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.91 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.17 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.97 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.1 
 
 
190 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  38.62 
 
 
208 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.5 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.82 
 
 
193 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  32.86 
 
 
176 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.61 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  30.61 
 
 
228 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
199 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
178 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.97 
 
 
189 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  32.64 
 
 
199 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  34.23 
 
 
203 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 
199 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.44 
 
 
219 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.92 
 
 
189 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
204 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.1 
 
 
221 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  33.56 
 
 
198 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.87 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  34.72 
 
 
199 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.08 
 
 
188 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.41 
 
 
212 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.57 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.17 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.79 
 
 
200 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.77 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
188 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.55 
 
 
196 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.88 
 
 
209 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  30.5 
 
 
188 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.97 
 
 
197 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.88 
 
 
185 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.61 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  29.66 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.8 
 
 
187 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.19 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  29.37 
 
 
218 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.2 
 
 
217 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
205 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>