270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2386 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.92 
 
 
188 aa  244  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  66.96 
 
 
116 aa  162  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.92 
 
 
188 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.55 
 
 
199 aa  148  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  37.77 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2398  dihydrofolate reductase  80 
 
 
65 aa  121  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  35.14 
 
 
182 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  33.16 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  34.04 
 
 
181 aa  110  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  33.51 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
187 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
187 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
187 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
187 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.89 
 
 
176 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
186 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
187 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
187 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.51 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.65 
 
 
188 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
188 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.96 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.43 
 
 
178 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.96 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  27.57 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
181 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
182 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  30.51 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.97 
 
 
181 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.97 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
199 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  27.78 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.27 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  28.88 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
189 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.35 
 
 
183 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  29.32 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  29.15 
 
 
198 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.75 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.03 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  25.82 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  25.98 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.34 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  30.92 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  30.53 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  28.11 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  25.12 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.21 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  26.94 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  29.32 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  27.66 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  29.21 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  24.87 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  30.71 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.74 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  29.19 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.21 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.96 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  24.74 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>