174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2516 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  48.15 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  47.09 
 
 		 195 aa  180  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.17 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  46.03 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  48.35 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  47.09 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  48.45 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  46.6 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  45.26 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  42.19 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  41.67 
 
 		 192 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  41.84 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  44.39 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.83 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  43.39 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.12 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  35.98 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  34.39 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.69 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  29.74 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  31.63 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.29 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  28.57 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.92 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  32.72 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  32.92 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.83 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.48 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  31.06 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  32.1 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  32.1 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  24.08 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  32.1 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.37 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.89 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  30.11 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  29.29 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  31.68 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.64 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  28.88 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.91 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.06 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  27.23 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.64 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.26 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.98 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.64 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  31 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  28.35 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  27.97 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.24 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.67 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.36 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.29 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  26.9 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.93 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.22 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.99 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  26.67 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  24.73 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.04 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  23.24 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  26.34 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  23.39 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.46 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  39.51 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  29.25 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.48 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.15 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.64 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>