121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3404 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  63.64 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  47.87 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.62 
 
 		 191 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  46.81 
 
 		 193 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  50 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  50 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.84 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  47.4 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  46.32 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  45.79 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.39 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  44.95 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  45.26 
 
 		 191 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  43.01 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  44.33 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.5 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.84 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.34 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.05 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.53 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  29.19 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  30.05 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.48 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  33.85 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.25 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.25 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  31.25 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  31.25 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.63 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  37.86 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.06 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  29.45 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  29.45 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  29.01 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  31.44 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  31.58 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  32.82 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.86 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  29.1 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.02 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  28.65 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  26.84 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  25.93 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  28.88 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.7 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  42.47 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  34.31 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  27.64 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.6 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.57 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  24.1 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.02 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.7 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.38 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.02 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.71 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  25 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.66 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  32.69 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.7 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  28.34 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  28.75 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  28.64 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.01 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.67 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.13 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>