181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2481 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  44.32 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.11 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  40.45 
 
 
181 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  40.45 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.87 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  36.87 
 
 
183 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  37.85 
 
 
390 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  40.8 
 
 
207 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  37.14 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  40.12 
 
 
178 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  37.36 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 
181 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.42 
 
 
176 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.14 
 
 
212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  39.66 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  37.36 
 
 
177 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.71 
 
 
186 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  35.29 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  36.76 
 
 
199 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
178 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  34.86 
 
 
177 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  38.95 
 
 
180 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  32.57 
 
 
177 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
181 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  38.8 
 
 
184 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.21 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  32.56 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  28.96 
 
 
199 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  32.95 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  33 
 
 
210 aa  87.8  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  31.25 
 
 
180 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.29 
 
 
177 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.67 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  84.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.09 
 
 
184 aa  84.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.53 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  31.84 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.36 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.1 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.49 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  31.1 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  31.1 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  31.1 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  31.1 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  30.49 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  30.49 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  31.61 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  31.1 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25.86 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.27 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.25 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.84 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  25.97 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.86 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  28.34 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.14 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  25.14 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.88 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  28.86 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.26 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  25.54 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.43 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.44 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.96 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  28.9 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.32 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.37 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.97 
 
 
190 aa  57.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.99 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.02 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  38.03 
 
 
75 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.52 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.63 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  27.63 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  26.7 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  26.9 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  25.28 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.41 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.91 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.68 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  26.56 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  26.4 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  25.71 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>