264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5690 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  46.89 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  49.72 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  38.07 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  37.44 
 
 
191 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  40.21 
 
 
195 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  38.14 
 
 
195 aa  111  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  39.69 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.31 
 
 
197 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
176 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  37 
 
 
198 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.76 
 
 
193 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  37.19 
 
 
194 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
178 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
174 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.85 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
191 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  34.83 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.82 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  32.28 
 
 
190 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  34.08 
 
 
180 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  35.84 
 
 
173 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  30.06 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.46 
 
 
194 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  29.48 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.36 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.66 
 
 
196 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.29 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  32.28 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.4 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  28.18 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.57 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  31.49 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.9 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.34 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  28.57 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  28.57 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  30.77 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  28.57 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  29.48 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  31.16 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  31.84 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.11 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.71 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  34.83 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  34.12 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.54 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  32.96 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.82 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  30.17 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  31.4 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  32.37 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  29.51 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.74 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.82 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  31.58 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.32 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  28.83 
 
 
116 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  32.11 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.82 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30.16 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  30.68 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.03 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  30.68 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  27.72 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.81 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  25.91 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.46 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.93 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.56 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.22 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.98 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  26.98 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  26.98 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.53 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.59 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  30.06 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>