154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4561 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  55.33 
 
 
194 aa  209  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  51.52 
 
 
198 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  51.53 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  49.48 
 
 
193 aa  175  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  48.22 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  45.45 
 
 
190 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  43.94 
 
 
192 aa  150  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  42.13 
 
 
190 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  37.5 
 
 
191 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.1 
 
 
191 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.13 
 
 
191 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.12 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
193 aa  134  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  43.78 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  44.5 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.88 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  41.71 
 
 
191 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.46 
 
 
194 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.56 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 
176 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  29.5 
 
 
172 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.83 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  32.32 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  32.16 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.18 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  33.99 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.54 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.45 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  29.09 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  26.9 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  27.54 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  29.09 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  28.48 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  28.48 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.48 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.48 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.09 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  28.48 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  28.74 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.94 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.87 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.58 
 
 
178 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.15 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.14 
 
 
178 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.19 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.12 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.99 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  27.88 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  28.66 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  25.84 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.17 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.39 
 
 
177 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  29.59 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.94 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.74 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.17 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.38 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.2 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  25.5 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.1 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.94 
 
 
185 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.71 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  27.91 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.36 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.59 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.14 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.88 
 
 
183 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  29.59 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  23.71 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.47 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.67 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.9 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.4 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.19 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2085  deaminase-reductase domain-containing protein  37.21 
 
 
242 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.242441  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.31 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.25 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.96 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.79 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.48 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  27.06 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.96 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.65 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  28 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>