155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2085 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2085  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
242 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.242441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1085  deaminase-reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
197 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.655465  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5731  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.96 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3984  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.31 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.02 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.06 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.91 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.3 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  28.05 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.61 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.1 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.56 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  34.09 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  32.11 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.12 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 
185 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.13 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.48 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.04 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.42 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  29.08 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.25 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
185 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
190 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
182 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.18 
 
 
181 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.14 
 
 
178 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.1 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.66 
 
 
194 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
204 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.49 
 
 
181 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
187 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  30.59 
 
 
177 aa  62.4  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  28.96 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
182 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  33.96 
 
 
182 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.08 
 
 
204 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.48 
 
 
186 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.78 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.03 
 
 
189 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  29.65 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.68 
 
 
177 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.17 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.67 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.47 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.15 
 
 
187 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.56 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.49 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.38 
 
 
182 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.62 
 
 
180 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.54 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.42 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.66 
 
 
176 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.49 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.5 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
186 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.98 
 
 
198 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  29.41 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  28.12 
 
 
180 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.34 
 
 
183 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
221 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  25.39 
 
 
185 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.23 
 
 
217 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  26.49 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
178 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  26.15 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.97 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.56 
 
 
178 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  29.35 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  30.47 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.59 
 
 
187 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.49 
 
 
188 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.8 
 
 
193 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.66 
 
 
196 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 
178 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.33 
 
 
221 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.05 
 
 
181 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0339  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 
188 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.183511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.06 
 
 
219 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.98 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  43.08 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  30.2 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.5 
 
 
183 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  27.37 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
190 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.4 
 
 
190 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
157 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.21 
 
 
197 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>