191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1735 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.19 
 
 
191 aa  197  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  52.94 
 
 
195 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  52.94 
 
 
195 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  50 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  49.21 
 
 
197 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.15 
 
 
191 aa  181  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  50.9 
 
 
190 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  48.15 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.94 
 
 
191 aa  177  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  50.78 
 
 
198 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  47.92 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
194 aa  171  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  47.03 
 
 
191 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  46.81 
 
 
196 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.39 
 
 
189 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  43.16 
 
 
191 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
197 aa  134  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  31.55 
 
 
194 aa  84.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.96 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  28.95 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  30.86 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  30.86 
 
 
174 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  29.03 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.48 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  29.71 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  31.43 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  31.43 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  31.18 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  31.43 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  29.71 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.71 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  27.84 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  30.61 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.32 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.36 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  26.77 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  40.74 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.14 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  31.31 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  27.17 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.85 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  27.41 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.8 
 
 
185 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.19 
 
 
188 aa  61.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.67 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.41 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.65 
 
 
179 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  26.98 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  28.35 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  29.53 
 
 
175 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.35 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.13 
 
 
217 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.37 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  29.61 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.88 
 
 
181 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.87 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  29.95 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
177 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.88 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.86 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.13 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  26.25 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  26.32 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.58 
 
 
180 aa  55.1  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.84 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.57 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.37 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.35 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  21.93 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.93 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.5 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  28.22 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.33 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  25.71 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2085  deaminase-reductase domain-containing protein  27.8 
 
 
242 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.242441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.22 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.25 
 
 
183 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  26.22 
 
 
172 aa  52  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>