135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5023 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.52 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32930  dihydrofolate reductase  50.51 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  49.49 
 
 		 195 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  50.78 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  49.41 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  47.21 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.96 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.84 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.93 
 
 		 191 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  39.29 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.92 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  44.95 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  43.65 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  41.71 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  41.12 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  37.37 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  38.42 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  31.98 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.34 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.67 
 
 		 178 aa  84.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.37 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.5 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  31 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  27.14 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.77 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  30.18 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1850  bifunctional deaminase-reductase-like  31.43 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.18 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  29.59 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  29.59 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  30.18 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  30.18 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  32.47 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  29.55 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.4 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.65 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.63 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  29.76 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  30.25 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  30.92 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.53 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.81 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.47 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.98 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.75 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.62 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.23 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.86 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.48 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.23 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  24.74 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  28.02 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.96 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.12 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  27.54 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.81 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  23.53 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  25.85 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.6 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.64 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  28.93 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.46 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.74 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.95 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.73 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.54 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  21.32 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.79 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.83 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.38 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>