181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2892 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  49.71 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  49.71 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  49.14 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.19 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.46 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.09 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.93 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  43.51 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  44.16 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.43 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.56 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.21 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  39.68 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  41.71 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.21 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.23 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.25 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  40.25 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  39.51 
 
 		 182 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.31 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.01 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  34.64 
 
 		 180 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  32.18 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  34.69 
 
 		 173 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.73 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.48 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  32.19 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.67 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  32.19 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  34.67 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  31.51 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.17 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  31.51 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  26.74 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30.6 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  30.82 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  32.58 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.96 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  30.77 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.54 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.74 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  29.49 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  29.49 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  32.89 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  27.7 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.52 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  32.22 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.45 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.96 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  27.17 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  30.86 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  24.42 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.08 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  28.66 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  29.12 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  28.72 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.33 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.68 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.14 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  25.15 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.03 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.24 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.07 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  33.13 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.51 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  25.15 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  36.08 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>