158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3761 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  49.07 
 
 
215 aa  209  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  48.84 
 
 
215 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 
220 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  49.3 
 
 
215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  46.48 
 
 
215 aa  197  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  53.46 
 
 
217 aa  194  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.66 
 
 
220 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.66 
 
 
220 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.95 
 
 
213 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  47.25 
 
 
221 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.95 
 
 
219 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.79 
 
 
214 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.26 
 
 
220 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  43.66 
 
 
213 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  47.89 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  46.4 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  54.08 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.83 
 
 
214 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  46.05 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.26 
 
 
219 aa  177  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  46.67 
 
 
210 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.48 
 
 
213 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
219 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  42.72 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.06 
 
 
199 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.08 
 
 
218 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.95 
 
 
218 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.59 
 
 
213 aa  158  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  47.62 
 
 
214 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  45.5 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  45.5 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  45.5 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.22 
 
 
206 aa  147  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.76 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.76 
 
 
211 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.81 
 
 
214 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  43.55 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.78 
 
 
214 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  44.97 
 
 
190 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  52.34 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.05 
 
 
206 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  38.5 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.97 
 
 
240 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
222 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  36.92 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.69 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  37.38 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.36 
 
 
206 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.24 
 
 
211 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.1 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.56 
 
 
370 aa  91.3  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.01 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.39 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  37.22 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  33.14 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.36 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.6 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.7 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  31.11 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.04 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.64 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.12 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.4 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.44 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.99 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  32.57 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.07 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  33.93 
 
 
194 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.12 
 
 
173 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  28.9 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  30.68 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  27.98 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31.43 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.24 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  32.95 
 
 
180 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
189 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.65 
 
 
179 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  27.87 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  26.26 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  38.16 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.66 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0026  dihydrofolate reductase region  27.13 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000208627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  29.44 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  29.14 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.48 
 
 
187 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.66 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  35.66 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.6 
 
 
181 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.14 
 
 
187 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>