175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5756 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  51.16 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  51.85 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  50.23 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  49.32 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  51.39 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.23 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.16 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.75 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  51.08 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.83 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.83 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.05 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  48.37 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.83 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.98 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  45.98 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.12 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  44.86 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.96 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  54.5 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  47.2 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.12 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  46.01 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.12 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.72 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.93 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.55 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  45.7 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.28 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.58 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.69 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.78 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  39.46 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  38.77 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  47.56 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.67 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.47 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  40.4 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  40.4 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  40.4 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  39.91 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.42 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  38.18 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.86 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  35.16 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  42.94 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.95 
 
 		 370 aa  101  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  35.55 
 
 		 180 aa  99  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  35.81 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.42 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.67 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.37 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  33.81 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.82 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.52 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.17 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.48 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.44 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  30.09 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.51 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  33.56 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.77 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.46 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.29 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  25.13 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 181 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 187 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.04 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.11 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  38.04 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  24.66 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.85 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  23.76 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  24.21 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.81 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.96 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.18 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>