135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1206 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  81.36 
 
 
222 aa  377  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  68.33 
 
 
206 aa  303  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  53.27 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.95 
 
 
206 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.87 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.87 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.61 
 
 
240 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.38 
 
 
220 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.87 
 
 
219 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
215 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.65 
 
 
218 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  39.61 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.23 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  40.74 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  39.63 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.04 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  42.92 
 
 
217 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  42.35 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.85 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.92 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  38.98 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  43.02 
 
 
223 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.38 
 
 
213 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
227 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
199 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  37.25 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  35.43 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 
201 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.4 
 
 
211 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
213 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  40.38 
 
 
214 aa  101  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35 
 
 
210 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  34.65 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  44.36 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  44.36 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  44.36 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  44.85 
 
 
200 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  35.68 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.96 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.64 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  36.56 
 
 
190 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.1 
 
 
187 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  40.15 
 
 
194 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  40.28 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.1 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.86 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.44 
 
 
199 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  39.42 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.02 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.41 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
180 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  29.49 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  31.34 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  38.19 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.37 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  33.81 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.78 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  30 
 
 
197 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  29.66 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.78 
 
 
370 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.54 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.19 
 
 
177 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.46 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  28.08 
 
 
180 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 
182 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  26.95 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  46.94 
 
 
373 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  31.13 
 
 
200 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  27.46 
 
 
178 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.93 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.95 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.59 
 
 
178 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  24.52 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  28.93 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.96 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
183 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.33 
 
 
178 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  21.76 
 
 
173 aa  45.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
177 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.12 
 
 
228 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.42 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  24.06 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.4 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  26.12 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  27.52 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>