98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1051 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  69.95 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  67.92 
 
 		 217 aa  293  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  64.98 
 
 		 223 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.14 
 
 		 219 aa  274  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.62 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  58.02 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  56.82 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  55.56 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.91 
 
 		 211 aa  228  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  56.42 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  51.74 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  53.55 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  51.74 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  51.74 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  52.86 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  49.06 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  51.66 
 
 		 215 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  52.94 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  49.29 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  47.89 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  49.73 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.52 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.4 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.78 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  50 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  47.98 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.8 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.8 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  48.29 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.59 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  60.13 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  51.3 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.61 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.66 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  46.26 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.95 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  50 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  45.5 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.58 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.98 
 
 		 370 aa  137  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.79 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.92 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  45.9 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  47.53 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 212 aa  98.2  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.06 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.06 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.53 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.94 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  37.29 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  31.86 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.08 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.33 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  34.31 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  37.68 
 
 		 178 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.68 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  27.57 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  28.48 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.76 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.95 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  29.11 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  30.51 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.93 
 
 		 183 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  30.05 
 
 		 193 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.72 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.12 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.59 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.23 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.08 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.88 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  28.75 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 		 188 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  33.78 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 180 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>