130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 223 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  75.46 
 
 		 219 aa  335  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  77.31 
 
 		 219 aa  324  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  67.44 
 
 		 217 aa  288  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.98 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  62.5 
 
 		 210 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.14 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  54.67 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  51.39 
 
 		 215 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.73 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  55.14 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  48.84 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  48.61 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  50.23 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  51.85 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.64 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  52.88 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.39 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.39 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  51.17 
 
 		 214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  51.22 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  51.22 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  51.22 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.4 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.98 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  48.84 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  47.95 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.36 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  51.15 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  45.98 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  46.79 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.98 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  46.05 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.05 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.83 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  56.52 
 
 		 200 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  44.95 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.7 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.05 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.08 
 
 		 370 aa  141  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  44.62 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  40.18 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  46.34 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.46 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  43.02 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.51 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.44 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.89 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.99 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  35.02 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.15 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.18 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.65 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  38.51 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.7 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.09 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  35.06 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.81 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.46 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  42.65 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.5 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.11 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.28 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.07 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.12 
 
 		 184 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.34 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.54 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.62 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.17 
 
 		 390 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  29.03 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.8 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30.95 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.89 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.8 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  38.1 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  26.43 
 
 		 181 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.98 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  26.22 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  23.96 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  31.21 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.05 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.67 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>