105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6866 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.61 
 
 		 213 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  64.79 
 
 		 213 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  88.2 
 
 		 190 aa  278  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  66.2 
 
 		 213 aa  270  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.21 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.21 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.9 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  64.81 
 
 		 217 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.18 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.48 
 
 		 220 aa  257  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  58.22 
 
 		 215 aa  257  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  57.8 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  55.87 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  55.4 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  57.01 
 
 		 214 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  59.28 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.53 
 
 		 218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  54.93 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  54.46 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  50.23 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.44 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  46.05 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.67 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.84 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.08 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  50.49 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.87 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.33 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.76 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  43.33 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.45 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  45.7 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.15 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  45.02 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  44.51 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  44.51 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  44.51 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.51 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  42.78 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.59 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  37.79 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.66 
 
 		 370 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.11 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  38.38 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  48.87 
 
 		 200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.45 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.67 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.95 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.69 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.42 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.82 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  30.99 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  28.08 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.86 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  32.54 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  40.23 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.78 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  39.77 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.06 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  34.51 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.37 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  35.63 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.4 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  41.07 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.12 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.66 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.74 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.19 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  38.98 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.1 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1173  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.91 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.12 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.28 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.23 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.04 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.12 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  42.37 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>