115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3505 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  82.11 
 
 		 219 aa  367  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  77.31 
 
 		 223 aa  336  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  68.95 
 
 		 217 aa  307  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.14 
 
 		 218 aa  288  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  60.65 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.53 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  56.62 
 
 		 211 aa  241  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  56.48 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  56.02 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  51.39 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  52.07 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.55 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  51.16 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  50.46 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.77 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.77 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.77 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  51.63 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  49.77 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.22 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.23 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  49.08 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  51.83 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  46.98 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  47.96 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  49.53 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.44 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.77 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.91 
 
 		 213 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  49.77 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  59.63 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  48.84 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  48.62 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  44.34 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.32 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.08 
 
 		 370 aa  141  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.63 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  46.67 
 
 		 190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  45.21 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.18 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  37.27 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.91 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  36.76 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.98 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.89 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.3 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.37 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.34 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  28.42 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.11 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.65 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  35 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31.4 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  31.85 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  33.57 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.94 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 		 180 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.89 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.33 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  40.3 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.61 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.27 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.68 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.77 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.48 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.13 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.24 
 
 		 180 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.86 
 
 		 173 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.5 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.38 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.72 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.17 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.1 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.9 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>