252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3877 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
182 aa  360  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  48.37 
 
 
187 aa  170  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  38.17 
 
 
180 aa  111  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 
199 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  38.33 
 
 
193 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  37.25 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.87 
 
 
197 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.8 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  35.15 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.23 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.96 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.98 
 
 
206 aa  88.6  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  37.02 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.89 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  36.6 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.93 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  34.01 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.75 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  38.28 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.8 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.17 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  41.8 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  40.5 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  31.75 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  36.78 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.2 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.63 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.34 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  37.31 
 
 
215 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.31 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.23 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  33.98 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.29 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  39.1 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  39.55 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  34.97 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  32 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  35.42 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.4 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.27 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  30.48 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.7 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  34.31 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  34.31 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  34.31 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.21 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.14 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.48 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  39.34 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  31.07 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  29.73 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  32.48 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  33.5 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.35 
 
 
370 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.91 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
206 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.48 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.92 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.14 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.01 
 
 
218 aa  60.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.21 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.41 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  31.89 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.51 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.9 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.16 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  33.97 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.39 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  33.59 
 
 
214 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  31.71 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.93 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.77 
 
 
188 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.65 
 
 
173 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  30.86 
 
 
193 aa  57.8  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  30.64 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.09 
 
 
214 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  27.53 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.22 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>