191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2032 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  60.21 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  42.71 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  39.9 
 
 
193 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.89 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.68 
 
 
197 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.75 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.89 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.61 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.07 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.25 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  36 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.42 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.44 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.84 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.21 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.98 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  35.54 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  32.2 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.72 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  35.33 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.68 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  35.71 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.59 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  35.52 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  33.15 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.65 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  34.33 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.84 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  32.13 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.33 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  34.86 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  31.01 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  33.64 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.06 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.78 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  35.11 
 
 
180 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  30.53 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.56 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.75 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  32.07 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  29.47 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.84 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  29.23 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.07 
 
 
180 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.21 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  28.66 
 
 
178 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  29.32 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.76 
 
 
178 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
187 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.5 
 
 
188 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
370 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  29.95 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.15 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.22 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  30 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  24.21 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  33.11 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.83 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  28.03 
 
 
198 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  28.3 
 
 
196 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 
189 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  24.28 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.22 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.92 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  22.22 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.6 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  26.32 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.11 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.24 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.97 
 
 
181 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.54 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  28.32 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  35.34 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>