156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2523 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  87.32 
 
 
213 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  67.14 
 
 
213 aa  305  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.95 
 
 
220 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.95 
 
 
220 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  59.62 
 
 
215 aa  280  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  67.61 
 
 
210 aa  278  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.81 
 
 
220 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.36 
 
 
219 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  56.81 
 
 
215 aa  274  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  58.22 
 
 
215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  60.09 
 
 
221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.73 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  60.28 
 
 
214 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  62.96 
 
 
217 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  55.4 
 
 
215 aa  270  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  56.81 
 
 
214 aa  259  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.14 
 
 
218 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  56.11 
 
 
227 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  47.89 
 
 
217 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.23 
 
 
219 aa  201  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.44 
 
 
219 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  64.02 
 
 
190 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  52.36 
 
 
223 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.95 
 
 
201 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  46.26 
 
 
210 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.46 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.59 
 
 
218 aa  181  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  49.75 
 
 
201 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.26 
 
 
213 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.81 
 
 
214 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  43.85 
 
 
214 aa  157  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  43.72 
 
 
216 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  43.72 
 
 
216 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  43.72 
 
 
216 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.94 
 
 
199 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.16 
 
 
211 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  42 
 
 
215 aa  148  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  37.9 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  39.45 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.92 
 
 
206 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.98 
 
 
214 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
222 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
221 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.44 
 
 
206 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.35 
 
 
206 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  43.82 
 
 
200 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  37.56 
 
 
230 aa  128  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.78 
 
 
240 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.55 
 
 
370 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.32 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.3 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.61 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.37 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  35.02 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.44 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.24 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.88 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.9 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.26 
 
 
182 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.55 
 
 
197 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  30.73 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  35.54 
 
 
193 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  33.16 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  30.6 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  33.09 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  30.81 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.86 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.36 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.82 
 
 
183 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.52 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.12 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  39.68 
 
 
178 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.52 
 
 
177 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  34.52 
 
 
177 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.46 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.58 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.12 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.03 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.85 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.22 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.69 
 
 
174 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.73 
 
 
173 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.07 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
182 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  29.01 
 
 
176 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  29.25 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.48 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.73 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 
186 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  27.91 
 
 
177 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>