199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1612 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.53 
 
 
206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  44.95 
 
 
221 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  42.47 
 
 
222 aa  168  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.33 
 
 
212 aa  165  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.55 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.83 
 
 
211 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  38.14 
 
 
215 aa  141  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.43 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.44 
 
 
213 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  35.89 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
220 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
220 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.07 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.87 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  35.15 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  35.15 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.64 
 
 
220 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.24 
 
 
214 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  36.02 
 
 
214 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  32.7 
 
 
215 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.14 
 
 
199 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  35.38 
 
 
217 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  35.32 
 
 
227 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  35.75 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  32.84 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.98 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.36 
 
 
201 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.07 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  32.55 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
213 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
223 aa  107  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
210 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.88 
 
 
206 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.13 
 
 
197 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
219 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.62 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.5 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.45 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  31.75 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  29.76 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  29.86 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.54 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  37.86 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  34.07 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  34.07 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  34.07 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  29.27 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.87 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.86 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.01 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  32.04 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  32.06 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.13 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  31.75 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  37.34 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.4 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.37 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.92 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.2 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31.75 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.49 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  30.29 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.85 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.57 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  30.17 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  27 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.25 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  28.65 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.43 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.6 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 
196 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  29.6 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  25.86 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  26.84 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.01 
 
 
175 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  23.11 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.29 
 
 
179 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
183 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.56 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.82 
 
 
184 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.6 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.13 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.32 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.62 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.37 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25.43 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  23.79 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  21.6 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.33 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  29.92 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.78 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  26.55 
 
 
183 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>