239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3571 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.98 
 
 
211 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.85 
 
 
214 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 
206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  37.37 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 
199 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.1 
 
 
201 aa  104  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
215 aa  104  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  35.44 
 
 
215 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  35.29 
 
 
215 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  34.31 
 
 
215 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.89 
 
 
206 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.96 
 
 
197 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.68 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  35.32 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
240 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.85 
 
 
220 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  33.5 
 
 
201 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.52 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  35.65 
 
 
216 aa  92  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.65 
 
 
220 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.25 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.61 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.85 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.15 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  34.47 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.87 
 
 
182 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
213 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.92 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.92 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  33.65 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.72 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  32.42 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  33.01 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  33.49 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  31.68 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.68 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  28.64 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.96 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.33 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  34.93 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  31.34 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  30.39 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  33.5 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  29.38 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.38 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.53 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  34.13 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.08 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.19 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  31.71 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.93 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.7 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.71 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  31.86 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.71 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  35.61 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  35.61 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  35.61 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  28.32 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  29.61 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.52 
 
 
184 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
176 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  27.94 
 
 
230 aa  61.6  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.85 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  33.11 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.89 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.53 
 
 
370 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.37 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.72 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  29.5 
 
 
176 aa  58.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  27.18 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.77 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.62 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  28.71 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.15 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  27 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.96 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.23 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.75 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.08 
 
 
179 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  27.23 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  33.33 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.34 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.27 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  32.34 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.18 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>