148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0352 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  68.54 
 
 
215 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  65.42 
 
 
220 aa  300  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  65.42 
 
 
220 aa  300  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  64.95 
 
 
215 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  63.85 
 
 
215 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  66.36 
 
 
214 aa  292  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.73 
 
 
220 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  61.97 
 
 
213 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.86 
 
 
220 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.56 
 
 
219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  63.55 
 
 
214 aa  286  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  63.01 
 
 
221 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.62 
 
 
213 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  63.96 
 
 
227 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  63.89 
 
 
218 aa  278  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.5 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  58.22 
 
 
210 aa  244  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  56.02 
 
 
217 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  52.8 
 
 
217 aa  217  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.05 
 
 
219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  48.84 
 
 
223 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.07 
 
 
201 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.16 
 
 
219 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.29 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  47.69 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.53 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.22 
 
 
213 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.15 
 
 
211 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  53.89 
 
 
190 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  48.33 
 
 
201 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  48.72 
 
 
216 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  48.72 
 
 
216 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  48.72 
 
 
216 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.44 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.51 
 
 
214 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  49.73 
 
 
214 aa  167  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  44.75 
 
 
216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  48.94 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  46.82 
 
 
219 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.8 
 
 
214 aa  154  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  40.61 
 
 
222 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  53.85 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.29 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.32 
 
 
206 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
221 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.78 
 
 
240 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.89 
 
 
206 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
370 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.35 
 
 
211 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.18 
 
 
212 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  38.35 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.76 
 
 
187 aa  82  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.6 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.67 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.57 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.68 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  32.77 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  35.48 
 
 
193 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  28.37 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.98 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.2 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 
185 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  32.33 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
178 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.71 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.34 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.94 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.85 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  27.61 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  33.98 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.42 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  26.85 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  27.87 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.76 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.34 
 
 
173 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  37 
 
 
180 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.85 
 
 
173 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  26.55 
 
 
183 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.85 
 
 
189 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  27.71 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  28.25 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  27.67 
 
 
178 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  25.62 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.9 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  29.5 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.5 
 
 
184 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.71 
 
 
386 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.94 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  28.83 
 
 
180 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>