150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3554 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  430  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  60.53 
 
 
218 aa  201  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.82 
 
 
197 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.08 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  40.2 
 
 
193 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.8 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.77 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.12 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.19 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.43 
 
 
240 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.98 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  34.01 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
197 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.74 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  36.55 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  32.32 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  32.64 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.13 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.44 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.96 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  37.78 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  32.21 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.71 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.71 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.27 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.54 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  30.7 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.07 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
184 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  30.29 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.24 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
183 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  30.88 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.86 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  34.52 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  28.85 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.49 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  29.61 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.26 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.48 
 
 
181 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.95 
 
 
390 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  28.85 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  26.98 
 
 
176 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  28.57 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.47 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.54 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  28.42 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.34 
 
 
178 aa  51.6  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  29.72 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  31.21 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  28.79 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
180 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.13 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  25.26 
 
 
173 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.02 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  27.66 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  31.29 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  25.93 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  27.88 
 
 
173 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  27.88 
 
 
173 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  27.88 
 
 
173 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  29.69 
 
 
192 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  26.54 
 
 
173 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  30.94 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.68 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.88 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.11 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.47 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  28.92 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.91 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
370 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  24.53 
 
 
173 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.22 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.26 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.26 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  25.62 
 
 
173 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.7 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>