158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2683 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  81.36 
 
 		 221 aa  377  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  70 
 
 		 206 aa  308  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  52.34 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.47 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.16 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.16 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.72 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.04 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.95 
 
 		 240 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  40.61 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.5 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  38.81 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  38.6 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  41.47 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  40.78 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.38 
 
 		 214 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.92 
 
 		 211 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.67 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  40.69 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.76 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  44.13 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.42 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  40.18 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  37.86 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  39.27 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  37.61 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.26 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.19 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.82 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  42.31 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  38.16 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.14 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.09 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  38.12 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.27 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.23 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  44.03 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  36.41 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  44.03 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  44.03 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  44.08 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.79 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  39.04 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.49 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.06 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.26 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  39.04 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.14 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  36.17 
 
 		 194 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.44 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.42 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 		 370 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  34.51 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  35.42 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  34.72 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  37.09 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.37 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.38 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.65 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  28.97 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.09 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.17 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.54 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  31.68 
 
 		 184 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  37.93 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.38 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.76 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.76 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 		 177 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.36 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  26.43 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  29.46 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  22.15 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  44.64 
 
 		 373 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.43 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.59 
 
 		 174 aa  48.9  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.76 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.86 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.39 
 
 		 180 aa  48.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.91 
 
 		 173 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>