135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1302 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.14 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.62 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.62 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  61.97 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.15 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  67.61 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  58.69 
 
 		 215 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  61.03 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  60.09 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  60.28 
 
 		 214 aa  275  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  57.75 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.45 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  58.72 
 
 		 221 aa  266  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  64.79 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.73 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.47 
 
 		 218 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  62.5 
 
 		 217 aa  256  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  57.92 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  48.13 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  52.88 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.36 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.83 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  63.58 
 
 		 190 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.73 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.08 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.66 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.65 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  44.86 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.99 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  45.99 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  46.28 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  46.28 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  46.28 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  46.27 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.84 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  43.52 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  42.01 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.68 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  41.74 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  50 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  38.6 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.41 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.24 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  40.32 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.55 
 
 		 370 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  38.98 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.15 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.69 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.03 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.28 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.56 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  26.73 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.87 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  30.33 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  28.71 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.3 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.77 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.54 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.61 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.05 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.9 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  33.9 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  35.42 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  27.49 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  31.03 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.02 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.43 
 
 		 183 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.17 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.26 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.12 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.22 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.61 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  29.51 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.58 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.61 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.73 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>