192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8364 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.43 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.47 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.93 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  34.13 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  39.55 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  42.96 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  34.39 
 
 		 223 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.93 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  35.75 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  43.31 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.19 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  41.46 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.72 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.09 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.37 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  39.52 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  38.52 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.42 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.42 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  31.78 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  32.09 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.68 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  35.41 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.97 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  38.89 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  34.69 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  34.17 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  38.26 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.25 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  34.97 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.67 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.34 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  33.17 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.5 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  32.17 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.73 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.88 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  32.89 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 		 370 aa  71.6  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  36.99 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.09 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  32 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.01 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.97 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  30.14 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  37.5 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.33 
 
 		 175 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.86 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.37 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  34.88 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.81 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  28.09 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.8 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.37 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.28 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.85 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.27 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  34.83 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  27.72 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.58 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.83 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  25.31 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.44 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.97 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.94 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.84 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.72 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>