101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2337 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  74.06 
 
 		 210 aa  321  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  64.79 
 
 		 211 aa  278  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  61.97 
 
 		 217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  60 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  58.6 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.62 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.53 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.98 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.98 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  47.22 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.26 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  44.65 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  49.31 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  50 
 
 		 214 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  44.86 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  47.22 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.26 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  43.46 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  43.19 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.93 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  43.5 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.19 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  46.04 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  47 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  46.04 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  46.04 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  46.7 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.18 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.82 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  43.19 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  44.55 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  42.33 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.59 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  43.78 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.93 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.32 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.2 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.69 
 
 		 370 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  49.44 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.12 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.79 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  42.68 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  38.21 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.82 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.21 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.09 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.86 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.33 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.56 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.04 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.54 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.34 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.39 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  32.96 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  30.99 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.3 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  35.65 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  37.04 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.94 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.1 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.16 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.09 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  33.05 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  38.24 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.15 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  30.69 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  24.88 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.15 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.2 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.33 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 		 197 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 		 187 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.1 
 
 		 157 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.59 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 183 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>