150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4484 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  86.45 
 
 		 220 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  86.45 
 
 		 220 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  83.64 
 
 		 220 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  65.89 
 
 		 215 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  66.36 
 
 		 215 aa  311  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  64.95 
 
 		 215 aa  301  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  64.68 
 
 		 221 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  64.95 
 
 		 215 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  63.47 
 
 		 219 aa  297  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  64.49 
 
 		 214 aa  294  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.73 
 
 		 220 aa  294  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  60.28 
 
 		 213 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.28 
 
 		 213 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  64.71 
 
 		 227 aa  284  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  62.15 
 
 		 213 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.86 
 
 		 218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  57.94 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  56.68 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  51.87 
 
 		 217 aa  226  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.98 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  46.98 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.44 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.29 
 
 		 218 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.26 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.93 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.69 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.79 
 
 		 214 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.59 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  45.79 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  51.4 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  47.03 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  47.03 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  47.03 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  46.82 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  47.09 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.91 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  47.09 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  46.12 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.74 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  40.38 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.78 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  40.85 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  57.35 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.3 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.31 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.47 
 
 		 370 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.24 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.04 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.44 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.32 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.72 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.52 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.8 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.78 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.74 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  31.96 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  29.73 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  30.61 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.84 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.77 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.79 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.36 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.27 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  31.01 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.89 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.72 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  27.42 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.56 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.06 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  38.67 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.61 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  26.58 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.82 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  24.62 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.91 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  31.15 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  27.48 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.91 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>