151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2567 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 370 aa  734    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1614  hypothetical protein  74.54 
 
 		 216 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.225791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  74.31 
 
 		 219 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1613  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  71.33 
 
 		 156 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.568107  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1276  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  71.62 
 
 		 153 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  47.47 
 
 		 217 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.61 
 
 		 213 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  46.08 
 
 		 223 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.47 
 
 		 219 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.16 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.24 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.16 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  45.87 
 
 		 215 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.04 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.44 
 
 		 211 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.59 
 
 		 220 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  43.32 
 
 		 215 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5453  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.98 
 
 		 210 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.34 
 
 		 219 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.91 
 
 		 218 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  41.47 
 
 		 213 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  43.32 
 
 		 215 aa  155  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  43.84 
 
 		 215 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  42.4 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 213 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.47 
 
 		 214 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  45.71 
 
 		 214 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  41.55 
 
 		 221 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.91 
 
 		 214 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  42.6 
 
 		 227 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6866  deaminase-reductase domain-containing protein  44.13 
 
 		 210 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.47 
 
 		 218 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  44.8 
 
 		 217 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 216 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 216 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 216 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.4 
 
 		 214 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.71 
 
 		 157 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1260  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 215 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.933847  normal  0.428318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.18 
 
 		 213 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6622  DNA-binding protein  46.91 
 
 		 200 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.09 
 
 		 214 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.48 
 
 		 201 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5625  putative deaminase-reductase  43.04 
 
 		 190 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.14 
 
 		 199 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  35.41 
 
 		 222 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.65 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 		 211 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 212 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.84 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  37.42 
 
 		 319 aa  92.8  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 221 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  45.69 
 
 		 201 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 		 206 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.9 
 
 		 317 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.9 
 
 		 317 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.58 
 
 		 240 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.49 
 
 		 157 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  31.94 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5295  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.77 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703739  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.44 
 
 		 158 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.79 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2812  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.89 
 
 		 154 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427675  normal  0.0900203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2723  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.61 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.17 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  36.61 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.45 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  34.03 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.58 
 
 		 197 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2819  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.25 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  40.3 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.1 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.61 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.62 
 
 		 206 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 193 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 194 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  35.67 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.59 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  35.59 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.75 
 
 		 177 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.4 
 
 		 180 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.21 
 
 		 218 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5890  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.88 
 
 		 155 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.79 
 
 		 192 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1801  hypothetical protein  40.85 
 
 		 154 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  23.2 
 
 		 183 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  36.94 
 
 		 193 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 		 181 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2861  activator of Hsp90 ATPase-like protein  36.63 
 
 		 158 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.1 
 
 		 173 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.88 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  33.64 
 
 		 183 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>