74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5295 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5295  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
159 aa  332  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703739  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2819  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  69.81 
 
 
159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  44.68 
 
 
329 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.61 
 
 
317 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.61 
 
 
317 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  40.79 
 
 
319 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.82 
 
 
322 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.01 
 
 
157 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2723  hypothetical protein  38.22 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.71 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.91 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.58 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2812  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427675  normal  0.0900203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.81 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2861  activator of Hsp90 ATPase-like protein  37.5 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1276  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.58 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1613  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.25 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.568107  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5890  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.8 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.77 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1801  hypothetical protein  24.68 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41183  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4251  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.19 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.870353  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.79 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.15 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.2 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.47 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.15 
 
 
159 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.82 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  31.93 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18320  hypothetical protein  30.17 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.360116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  27.69 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.21 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.94 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.29 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  28.57 
 
 
160 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.08 
 
 
290 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  30.89 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  31.11 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.46 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0317  hypothetical protein  28.45 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1131  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.87 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.805713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.32 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  26.13 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  25.66 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0694  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.07 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0280865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.82 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  30.51 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0829  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.82 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.4 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.57 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.45 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.32 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6865  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.37 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.72 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.58 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  28.7 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1167  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.84 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.957262  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0476  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.45 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  unclonable  0.0000000161717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  26.09 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4276  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.89 
 
 
164 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1157  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.43 
 
 
144 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1140  activator of Hsp90 ATPase 1-like protein  30.43 
 
 
144 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  33.87 
 
 
360 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.23 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00881054  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4113  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.08 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.893389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.55 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0650  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.57 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0604  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.94 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>