141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2543 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3717  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  75.68 
 
 		 148 aa  253  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7185  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  75 
 
 		 148 aa  246  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  72.6 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0317  hypothetical protein  74.66 
 
 		 148 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  67.57 
 
 		 148 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5150  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  70.55 
 
 		 147 aa  225  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.89 
 
 		 149 aa  222  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  69.23 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  66.89 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1608  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  65.99 
 
 		 148 aa  219  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2266  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  67.35 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173847  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2631  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  69.18 
 
 		 147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.86 
 
 		 149 aa  217  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  65.75 
 
 		 147 aa  214  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.171783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4801  hypothetical protein  66.67 
 
 		 148 aa  213  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.9 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.44 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  65.07 
 
 		 147 aa  210  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3535  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.63 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  64.38 
 
 		 147 aa  204  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  63.89 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  64.83 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2210  activator of Hsp90 ATPase family protein  57.34 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3671  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  58.04 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834588 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1890  activator of Hsp90 ATPase family protein  58.04 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2085  activator of Hsp90 ATPase family protein  57.34 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  54.41 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  38.13 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0188  hypothetical protein  39.07 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4803  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.56 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5344  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.56 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.27 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4808  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.41 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  0.85508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5400  activator of Hsp90 ATPase-like protein  38.41 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5461  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.41 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.84 
 
 		 249 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1831  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.67 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948709  hitchhiker  0.00916424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1654  hypothetical protein  37.23 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2028  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.18 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5435  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.91 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.740658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.49 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0245007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0754  hypothetical protein  35.46 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0663  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1406  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.82 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  28.86 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  28.86 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  28.86 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5623  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.1 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  28.97 
 
 		 360 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.85 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  30.28 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1326  activator of Hsp90 ATPase-like protein  31.78 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.09 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0561  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.94 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.53 
 
 		 434 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1458  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.55 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520072  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1121  hypothetical protein  29.17 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0695467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  27.34 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4113  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.893389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.85 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.43 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  28.68 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2032  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.73 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4451  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.66 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.46 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.46 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1556  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.33 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00676118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.06 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.06 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.06 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1131  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.09 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.805713  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36650  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.82 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.54 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2425  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.08 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152043  normal  0.0111612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0476  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.33 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  unclonable  0.0000000161717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0787  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.24 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.667312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3046  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.73 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362039  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  27.91 
 
 		 319 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  29.05 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.57 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.63 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00881054  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1072  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.17 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.06 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.06 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  32.99 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  31.29 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.99 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1719  hypothetical protein  30.6 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  31.3 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.59 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1913  hypothetical protein  32.58 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.96 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1855  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.77 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.67 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>