74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1917 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  331  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  44.6 
 
 
148 aa  131  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0651  hypothetical protein  39.57 
 
 
149 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2280  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.57 
 
 
150 aa  117  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483226  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3717  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.73 
 
 
148 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1608  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.57 
 
 
148 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2543  hypothetical protein  38.13 
 
 
148 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.689147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2266  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.57 
 
 
156 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173847  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2631  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.03 
 
 
147 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5150  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.21 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  35.92 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.21 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.171783  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7185  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.17 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3535  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.62 
 
 
147 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.92 
 
 
147 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0317  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.69 
 
 
154 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.97 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1522  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.25 
 
 
151 aa  97.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000359291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.81 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3671  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.81 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0834588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4801  hypothetical protein  34.53 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1890  activator of Hsp90 ATPase family protein  34.97 
 
 
149 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2210  activator of Hsp90 ATPase family protein  32.87 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  30.82 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2085  activator of Hsp90 ATPase family protein  33.57 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.61 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5344  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4803  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4808  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  0.85508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0188  hypothetical protein  32.67 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248641 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5461  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.67 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5400  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.67 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.58 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3321  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
249 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5435  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.11 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.740658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1831  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948709  hitchhiker  0.00916424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1654  hypothetical protein  29.73 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.403228  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.08 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0245007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2028  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.2 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  25.85 
 
 
286 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  25.85 
 
 
286 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  25.85 
 
 
286 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  26.81 
 
 
360 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0663  hypothetical protein  29.08 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0754  hypothetical protein  28.87 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4451  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.78 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1326  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.35 
 
 
141 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.55 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5623  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.83 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2501  glutathione S-transferase-like protein  27.27 
 
 
360 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.919556  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.41 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1406  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.11 
 
 
207 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.94 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  25.87 
 
 
157 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01613  hypothetical protein  23.19 
 
 
148 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.93 
 
 
154 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  26.06 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  24.52 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5065  hypothetical protein  26.25 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0628651  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.14 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2089  activator of Hsp90 ATPase-like protein  24.53 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  24.65 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3543  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.61 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314773  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.83 
 
 
240 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3796  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.58 
 
 
143 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266434  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1556  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.16 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00676118  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.03 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.06 
 
 
161 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8896  hypothetical protein  28.89 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.22195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>