62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5065 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5065  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0628651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6290  hypothetical protein  78.2 
 
 		 136 aa  218  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  67.97 
 
 		 133 aa  189  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.22195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3796  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  63.57 
 
 		 143 aa  173  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1414  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0194665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6720  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  54.14 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  0.793451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1708  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.13 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1448  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.977319  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3789  hypothetical protein  46.62 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1707  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.44 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.899317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2226  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.38 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  hitchhiker  0.0072885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.38 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.08 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  29.45 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.38 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.81 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  39.73 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  32.1 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.75 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.44 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.44 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.44 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.86 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.44 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  27.12 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  39.44 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0650  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.63 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  26.24 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.91 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.8 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.93 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.46 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  26.25 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.05 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6172  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0106151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.14 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4276  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.66 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.61 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3233  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.43 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  19.86 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.32 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.47 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.53 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.36 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2477  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.65 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0972892  normal  0.0646639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.12 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  29.87 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18320  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.360116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.76 
 
 		 161 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.298031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>