84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1414 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1414  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  287  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0194665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6290  hypothetical protein  51.82 
 
 
136 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1708  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50.38 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5065  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0628651  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1448  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  49.62 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.977319  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3796  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  49.28 
 
 
143 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.266434  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6720  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.27 
 
 
141 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  0.793451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.31 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.22195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3789  hypothetical protein  39.85 
 
 
137 aa  117  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1707  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.59 
 
 
137 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.899317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  29.33 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.86 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6172  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.32 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0106151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  30.11 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  38.36 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2226  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.34 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  hitchhiker  0.0072885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  25.34 
 
 
329 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  33.77 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3632  hypothetical protein  31.21 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147242  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.08 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.53 
 
 
168 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  30 
 
 
166 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1975  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.48 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.57 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2806  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.62 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.25 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.06 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.27 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.12 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.72 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2477  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.34 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0972892  normal  0.0646639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  36.49 
 
 
319 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0650  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.21 
 
 
161 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1556  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.88 
 
 
161 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00676118  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.13 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0829  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.51 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.17 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  33.78 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.05 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.05 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.05 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.76 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1215  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.25 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2931  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.59 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531059  hitchhiker  0.000870821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3233  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.36 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5413  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.03 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0639907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.16 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.9 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.9 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1540  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.62 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241148  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  23.65 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.9 
 
 
290 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.03 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4073  hypothetical protein  27.27 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.29 
 
 
159 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2147  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.06 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.61 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.49 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18320  hypothetical protein  24.82 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.360116 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.58 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.94 
 
 
169 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.24 
 
 
240 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2089  activator of Hsp90 ATPase-like protein  27.14 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2859  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.43 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2413  hypothetical protein  38.89 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436069  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0511  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.96 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742769  normal  0.149633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  26.62 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.62 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4571  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.9 
 
 
322 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.75 
 
 
157 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.08 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  30.3 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01613  hypothetical protein  24.26 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1917  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.34 
 
 
149 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>