191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1959 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  68.55 
 
 
317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  68.55 
 
 
317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  57.73 
 
 
329 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  56.43 
 
 
322 aa  353  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3435  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.75 
 
 
157 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  45.71 
 
 
157 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2723  hypothetical protein  46 
 
 
152 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138119  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2064  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  46.21 
 
 
158 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0142  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.95 
 
 
157 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255389 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5295  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.79 
 
 
159 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.703739  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.38 
 
 
157 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.993443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2297  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.14 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.496603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4594  hypothetical protein  42.58 
 
 
155 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2819  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.14 
 
 
159 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1801  hypothetical protein  44 
 
 
154 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1276  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.06 
 
 
153 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2812  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.45 
 
 
154 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427675  normal  0.0900203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  36.65 
 
 
165 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.36 
 
 
156 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.88 
 
 
154 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.38 
 
 
155 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.38 
 
 
155 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.42 
 
 
370 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2861  activator of Hsp90 ATPase-like protein  38.16 
 
 
158 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1613  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.1 
 
 
156 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.568107  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  33.33 
 
 
160 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5890  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.13 
 
 
155 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  39.33 
 
 
169 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.33 
 
 
149 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.36 
 
 
160 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4102  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.87 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.1 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.51 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.3 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4977  hypothetical protein  29.7 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0491598  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.8 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.77 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2885  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.46 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.97 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3123  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.87 
 
 
162 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603064  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.11 
 
 
159 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32 
 
 
155 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.11 
 
 
159 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.21 
 
 
161 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.45 
 
 
157 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.11 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.11 
 
 
159 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.11 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5413  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.97 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0639907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0511  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.99 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742769  normal  0.149633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1205  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4276  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.92 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.99 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2682  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  29.11 
 
 
161 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6033  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.68 
 
 
167 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000241062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.01 
 
 
154 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3046  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.77 
 
 
169 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362039  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0650  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.88 
 
 
161 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2413  hypothetical protein  33.62 
 
 
155 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436069  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  29.3 
 
 
161 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.3 
 
 
161 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.3 
 
 
161 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 
161 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2931  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.79 
 
 
165 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531059  hitchhiker  0.000870821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.5 
 
 
180 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 
161 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.46 
 
 
169 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4251  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.25 
 
 
158 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.870353  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.51 
 
 
161 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.43 
 
 
156 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  30.41 
 
 
174 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.54 
 
 
160 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2617  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.17 
 
 
167 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673337 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 
164 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2859  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.48 
 
 
165 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.65 
 
 
168 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4159  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.2 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  33.72 
 
 
157 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.21 
 
 
169 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2271  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.29 
 
 
164 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0374055  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.57 
 
 
158 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00881054  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  32.35 
 
 
143 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1131  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.13 
 
 
163 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.805713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0604  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.48 
 
 
155 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2806  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.89 
 
 
157 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6865  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32 
 
 
178 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.14 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0835  hypothetical protein  31.25 
 
 
158 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.17 
 
 
165 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  33.58 
 
 
163 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2048  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
158 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.15 
 
 
142 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1072  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.33 
 
 
169 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 
163 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0829  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.03 
 
 
164 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.36 
 
 
142 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.84 
 
 
163 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>