215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0005 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
160 aa  332  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  65.62 
 
 
160 aa  230  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  67.33 
 
 
159 aa  220  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  67.11 
 
 
169 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.67 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.67 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  66.67 
 
 
159 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  62.09 
 
 
155 aa  214  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.84 
 
 
157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  61.69 
 
 
156 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  60.39 
 
 
155 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  60.39 
 
 
155 aa  204  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  59.18 
 
 
158 aa  203  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  60.14 
 
 
149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  58.22 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.66 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.66 
 
 
161 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50.33 
 
 
161 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  49.67 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2413  hypothetical protein  42.21 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436069  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.74 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  38.12 
 
 
161 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.12 
 
 
161 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.12 
 
 
161 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  38.75 
 
 
161 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1215  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.38 
 
 
158 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.27 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.27 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2089  activator of Hsp90 ATPase-like protein  39.33 
 
 
159 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2886  hypothetical protein  42.07 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.1 
 
 
162 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  37.35 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.41 
 
 
191 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0511  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.71 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742769  normal  0.149633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.16 
 
 
180 aa  87.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0604  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.52 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  34.36 
 
 
319 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.71 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.71 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.46 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.76 
 
 
192 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1205  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567309  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1131  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.76 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.805713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.3 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00881054  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4141  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.67 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3346  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.94 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  34.15 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2931  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.18 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531059  hitchhiker  0.000870821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.1 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2885  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.9 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2682  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.68 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2048  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.56 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2806  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.5 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3320  response regulator receiver domain-containing protein  31.41 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.0000398639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  31.9 
 
 
329 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0650  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5413  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.7 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0639907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2859  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.77 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.64 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4276  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.87 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.34 
 
 
322 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  37.82 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2271  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.84 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0374055  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.85 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4102  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.75 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1072  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.33 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1855  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.14 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3123  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.7 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603064  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1110  hypothetical protein  31.29 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000475267  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.54 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.23 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1366  hypothetical protein  42.71 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2226  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.24 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  hitchhiker  0.0072885 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2427  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.66 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  32.62 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2147  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0853  hypothetical protein  38.64 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2812  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.5 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427675  normal  0.0900203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0893  hypothetical protein  30.14 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.43 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1015  Hsp90 ATPase activator family protein  31.51 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4251  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.32 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.870353  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.21 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  33.75 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2032  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.72 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6033  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.38 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000241062  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.75 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3049  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.7 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2617  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.19 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4113  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.893389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.55 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.900009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.12 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4159  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.41 
 
 
295 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.43 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0692  hypothetical protein  35.29 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  31.13 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1906  hypothetical protein  26.22 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411397  hitchhiker  0.000261904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>