204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4554 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
161 aa  335  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  98.76 
 
 
161 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  96.89 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  90.68 
 
 
161 aa  306  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.63 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.66 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50.98 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.66 
 
 
159 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.66 
 
 
160 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  52.05 
 
 
160 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  48.08 
 
 
169 aa  157  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.99 
 
 
155 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.99 
 
 
155 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4030  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.59 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  normal  0.373747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3125  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.74 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.313514  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2856  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.08 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0332063  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.65 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  46.9 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.75 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2388  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.03 
 
 
162 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312436  normal  0.420624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  43.66 
 
 
157 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2413  hypothetical protein  39.04 
 
 
155 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436069  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  38.06 
 
 
161 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.06 
 
 
161 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  38.56 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.56 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.56 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.04 
 
 
161 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.06 
 
 
161 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2089  activator of Hsp90 ATPase-like protein  35.81 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  39.6 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1215  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.75 
 
 
158 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2886  hypothetical protein  39.01 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.73 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4141  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.12 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4102  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.1 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1205  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.76 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567309  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  35.06 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.19 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2931  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.72 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531059  hitchhiker  0.000870821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2048  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.67 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.14 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0604  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.68 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3346  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.76 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.38 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3320  response regulator receiver domain-containing protein  31.72 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.0000398639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0511  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.77 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742769  normal  0.149633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.36 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5413  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.71 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0639907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2885  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  33.11 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.68 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.85 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00881054  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4159  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.18 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1131  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.57 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.805713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2682  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.9 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6865  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.41 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2477  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.86 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0972892  normal  0.0646639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.76 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.87 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.31 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2806  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3360  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.04 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4251  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.74 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.870353  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1015  Hsp90 ATPase activator family protein  31.51 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1798  hypothetical protein  31.06 
 
 
329 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255644  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.82 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.79 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1855  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.05 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3201  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.65 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2226  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.61 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  hitchhiker  0.0072885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7745  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.61 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0829  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.58 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0476  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.65 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  unclonable  0.0000000161717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2032  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.03 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  27.59 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1998  hypothetical protein  23.23 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.07 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.92 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4113  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.65 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.893389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2859  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.94 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3123  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.94 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603064  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.74 
 
 
290 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2387  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.4 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  29.93 
 
 
360 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2212  hypothetical protein  28.95 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.38 
 
 
322 aa  57.4  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0864  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.72 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1556  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.66 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00676118  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.76 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.9 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2306  hypothetical protein  37.14 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1256  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.92 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0703772  normal  0.143196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01613  hypothetical protein  28.47 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2147  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.52 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2882  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.66 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0105994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>